蛋白互作是驗(yàn)證基因或疾病作用機(jī)理不可或缺的一環(huán),常用的檢測(cè)方法有:酵母雙雜、串聯(lián)親和純化、co-IP、FRET、熒光蛋白(螢光素酶)融合等。不同的檢測(cè)方法各有優(yōu)勢(shì),本期將介紹酵母雙雜的原理和優(yōu)勢(shì)。
· 酵母雙雜的原理 ·
酵母作為一種真核生物,其基因的轉(zhuǎn)錄需要反式作用因子的參與。反式作用因子GAL4由DNA結(jié)合域(BD)和轉(zhuǎn)錄激活域(AD)組成,完整的GAL4能結(jié)合至啟動(dòng)子上游順式作用元件并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄,導(dǎo)致下游基因的表達(dá)。
在構(gòu)建機(jī)制上,可將已知蛋白與BD構(gòu)建為融合蛋白,將待測(cè)蛋白和AD構(gòu)建為融合蛋白,若已知蛋白與待測(cè)蛋白存在相互作用,則兩者相互結(jié)合,導(dǎo)致BD與AD在空間上的距離非常相近,發(fā)揮完整的反式作用因子功能,啟動(dòng)下游報(bào)告基因表達(dá),可通過(guò)檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)判斷蛋白的互作水平。
在實(shí)際應(yīng)用中,通常有大量商業(yè)化產(chǎn)品直接使用,如AH109菌株,其既不能產(chǎn)生GAL4,又是Trp和Leu缺陷型菌株,無(wú)法在營(yíng)養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基中生長(zhǎng)。當(dāng)兩種配套載體所表達(dá)的融合蛋白能夠相互作用時(shí),完整的反式作用因子能夠激活酵母中基因表達(dá),使得酵母可在營(yíng)養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基上生長(zhǎng),達(dá)到篩選互作蛋白的功能。