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關(guān)于RNA降解詳細(xì)介紹

瀏覽次數(shù):587 發(fā)布日期:2023-11-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:

Trizol是一種總RNA抽提試劑,內(nèi)含異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速裂解細(xì)胞,抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法進(jìn)行提取組織或細(xì)胞中的RNA。

Trizol作用原理:

在勻質(zhì)化或溶解樣品中,Trizol試劑可保持RNA的完整性,同時能破壞細(xì)胞及溶解細(xì)胞成分。加入lv仿離心后,裂解液分層成水相和有機(jī)相。RNA存在于水相中。

水相轉(zhuǎn)移后,RNA通過異丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可從中間相沉淀得到DNA,加入異丙醇沉淀可從有機(jī)相得到蛋白質(zhì)。

接下來了解RNA提取中RNA降解原因:


一、RNA降解原因:

、 新鮮細(xì)胞
裂解液的量不足,使得裂解不充分。

2 、 新鮮組織:
某些含有內(nèi)源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。

3 、冷凍樣品:
樣品取材后應(yīng)該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉(zhuǎn)移到-70℃冰箱存放。如果未經(jīng)液氮速冷直接轉(zhuǎn)移到-70℃冰箱存放,會造成RNA緩慢降解。樣品研磨后,在液氮剛剛揮發(fā)完時,將樣品迅速轉(zhuǎn)移到含裂解液的容器中,立即混勻勻漿。

4 、內(nèi)源 RNA 酶的污染:
抑制劑失效或者用量不夠,實驗樣品過多或者勻漿溫度過高。
5 、 外源 RNA 酶的污染
試劑、器械等實驗用品應(yīng)該采用DEPC 水滅菌處理。

RNA降解是非常嚴(yán)重的問題,在RNA提取過程中,為防止降解我們需要遵守以下4點基本規(guī)則:

二、基本規(guī)則:

1. 把所有接觸RNA的塑料制品以及玻璃制品都高壓滅菌。
2. 用于RNA 緩沖液的所有水都要經(jīng)DEPC處理。加DEPC到終濃度0.1%,再室溫放放置過夜,或者滅菌15min 。DEPC 不能用于Tris 緩沖液,因為DEPC將會降解成乙醇和二氧化碳。
3. 避免堿性緩沖液,因為RNA中的羥基對堿非常敏感。
4. 將RNA 緩沖液與其他緩沖液分開放置,避免用錯或被RNases污染。
 
發(fā)布者:上海邦景實業(yè)有限公司
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