PEAKS Online 13蛋白質(zhì)組學(xué)分析平臺(tái)新版本發(fā)布

PEAKS^®Online是Bioinformatics Solutions Inc. (BSI)專門為高通量蛋白質(zhì)組學(xué)設(shè)計(jì)的分析平臺(tái)，具有超高的計(jì)算性能，并由深度學(xué)習(xí)賦能，為超大規(guī)模的DDA和DIA和蛋白質(zhì)學(xué)分析提供支持。

PEAKS^® Online 13 重構(gòu)DDA與DIA分析流，通過算法優(yōu)化實(shí)現(xiàn)了工作流的簡化與易用性的提升。借助用戶界面的升級、數(shù)據(jù)與系統(tǒng)穩(wěn)定性的提升，簡化參數(shù)設(shè)置，助力用戶將蛋白質(zhì)組學(xué)分析提升至全新高度！

01.架構(gòu)全面升級重構(gòu)

所有界面重新設(shè)計(jì)，系統(tǒng)穩(wěn)定性顯著增強(qiáng)，項(xiàng)目管理功能優(yōu)化，工作流及參數(shù)選擇大幅簡化，為用戶提供更加友好、高效的分析體驗(yàn)。


02.結(jié)果透明化呈現(xiàn)

新增的特征峰(Feature)列表，可與de novo only等其他Tab結(jié)合，查看每個(gè)鑒定序列對應(yīng)的所有MS1特征峰關(guān)聯(lián)信息，方便用戶對鑒定結(jié)果進(jìn)行校驗(yàn)與確認(rèn)。


03.提升 DIA 性能，實(shí)現(xiàn)深度挖掘
DIA數(shù)據(jù)庫搜索速度顯著提升，蛋白質(zhì)組鑒定結(jié)果更加精準(zhǔn)。為突破傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組學(xué)局限，PEAKS率先推出支持序列變異鑒定的DIA從頭測序算法，助力實(shí)現(xiàn)更深層的生物學(xué)發(fā)現(xiàn)。


 04. 自定義非標(biāo)記定量
用戶可深入分析樣本間的肽段/蛋白豐度差異。升級后的DDA Proteome workflow中，通過PEAKS PTM和SPIDER發(fā)現(xiàn)的未知修飾和突變肽段也可參與LFQ定量。
結(jié)果可視化新增樣本相關(guān)性散點(diǎn)圖和密度比率圖。DIA蛋白質(zhì)定量方法可靈活選擇，可選擇基于前3條獨(dú)特肽段或所有獨(dú)特肽段的MaxLFQ算法進(jìn)行計(jì)算。歸一化策略新增保留時(shí)間依賴型(RT Dependent)和全局型(Global)兩種選項(xiàng)。

05. 優(yōu)化DDA 和 DIA DeepNovo 多肽組分析流
DDA DeepNovo Peptidome workflow中的Gene Tab展示鑒定的多肽與基因的匹配關(guān)系，彌合了蛋白質(zhì)組學(xué)與基因組學(xué)的研究鴻溝。
DIA DeepNovo Peptidome workflow在準(zhǔn)確性與速度方面均進(jìn)行了優(yōu)化，現(xiàn)支持用戶自定義“候選列表”，形式可選擇譜圖庫(Spectral Library)或包含樣本中預(yù)期存在肽段的肽段列表(Peptide List)。
此外，結(jié)果中新增了蛋白質(zhì)列表展示，便于多肽與蛋白對應(yīng)。

 

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作為生物信息學(xué)的領(lǐng)軍企業(yè)，BSI專注于蛋白質(zhì)組學(xué)和生物藥領(lǐng)域，通過機(jī)器學(xué)習(xí)和先進(jìn)算法提供世界領(lǐng)先的質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析軟件和蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)解決方案，以推進(jìn)生物學(xué)研究和藥物發(fā)現(xiàn)。我們通過基于AI的計(jì)算方案，為您提供對蛋白質(zhì)組學(xué)、基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)的卓越洞見。旗下著名的PEAKS^®️系列軟件在全世界擁有數(shù)千家學(xué)術(shù)和工業(yè)用戶，包括：PEAKS^®️ Studio，PEAKS^®️ Online，PEAKS^®️ GlycanFinder, PEAKS^®️ AB，ProteoformX^TM ，DeepImmu^®️免疫肽組發(fā)現(xiàn)服務(wù)和抗體綜合表征服務(wù)等。
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