PEAKS Online 13蛋白質組學分析平臺新版本發(fā)布
PEAKS®Online是Bioinformatics Solutions Inc. (BSI)專門為高通量蛋白質組學設計的分析平臺，具有超高的計算性能，并由深度學習賦能，為超大規(guī)模的DDA和DIA和蛋白質學分析提供支持。
PEAKS® Online 13 重構DDA與DIA分析流，通過算法優(yōu)化實現了工作流的簡化與易用性的提升。借助用戶界面的升級、數據與系統穩(wěn)定性的提升，簡化參數設置，助力用戶將蛋白質組學分析提升至全新高度！
PEAKS® Online 13 新版本升級
01.架構全面升級重構
03.提升 DIA 性能，實現深度挖掘
DIA數據庫搜索速度顯著提升，蛋白質組鑒定結果更加精準。為突破傳統蛋白質組學局限，PEAKS率先推出支持序列變異鑒定的DIA從頭測序算法，助力實現更深層的生物學發(fā)現。
04. 自定義非標記定量
用戶可深入分析樣本間的肽段/蛋白豐度差異。升級后的DDA Proteome workflow中，通過PEAKS PTM和SPIDER發(fā)現的未知修飾和突變肽段也可參與LFQ定量。
結果可視化新增樣本相關性散點圖和密度比率圖。DIA蛋白質定量方法可靈活選擇，可選擇基于前3條獨特肽段或所有獨特肽段的MaxLFQ算法進行計算。歸一化策略新增保留時間依賴型(RT Dependent)和全局型(Global)兩種選項。
作為生物信息學的領軍企業(yè)，BSI專注于蛋白質組學和生物藥領域，通過機器學習和先進算法提供世界領先的質譜數據分析軟件和蛋白質組學服務解決方案，以推進生物學研究和藥物發(fā)現。我們通過基于AI的計算方案，為您提供對蛋白質組學、基因組學和醫(yī)學的卓越洞見。旗下著名的PEAKS®️系列軟件在全世界擁有數千家學術和工業(yè)用戶，包括：PEAKS®️ Studio，PEAKS®️ Online，PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB，ProteoformXTM ，DeepImmu®️免疫肽組發(fā)現服務和抗體綜合表征服務等。
Email: sales-china@bioinfor.com 電話：021-60919891
所有界面重新設計，系統穩(wěn)定性顯著增強，項目管理功能優(yōu)化，工作流及參數選擇大幅簡化，為用戶提供更加友好、高效的分析體驗。
02.結果透明化呈現
新增的特征峰(Feature)列表，可與de novo only等其他Tab結合，查看每個鑒定序列對應的所有MS1特征峰關聯信息，方便用戶對鑒定結果進行校驗與確認。02.結果透明化呈現
03.提升 DIA 性能，實現深度挖掘
DIA數據庫搜索速度顯著提升，蛋白質組鑒定結果更加精準。為突破傳統蛋白質組學局限，PEAKS率先推出支持序列變異鑒定的DIA從頭測序算法，助力實現更深層的生物學發(fā)現。
04. 自定義非標記定量
用戶可深入分析樣本間的肽段/蛋白豐度差異。升級后的DDA Proteome workflow中，通過PEAKS PTM和SPIDER發(fā)現的未知修飾和突變肽段也可參與LFQ定量。
結果可視化新增樣本相關性散點圖和密度比率圖。DIA蛋白質定量方法可靈活選擇，可選擇基于前3條獨特肽段或所有獨特肽段的MaxLFQ算法進行計算。歸一化策略新增保留時間依賴型(RT Dependent)和全局型(Global)兩種選項。
05. 優(yōu)化DDA 和 DIA DeepNovo 多肽組分析流
DDA DeepNovo Peptidome workflow中的Gene Tab展示鑒定的多肽與基因的匹配關系，彌合了蛋白質組學與基因組學的研究鴻溝。
DIA DeepNovo Peptidome workflow在準確性與速度方面均進行了優(yōu)化，現支持用戶自定義“候選列表”，形式可選擇譜圖庫(Spectral Library)或包含樣本中預期存在肽段的肽段列表(Peptide List)。
此外，結果中新增了蛋白質列表展示，便于多肽與蛋白對應。
作為生物信息學的領軍企業(yè)，BSI專注于蛋白質組學和生物藥領域，通過機器學習和先進算法提供世界領先的質譜數據分析軟件和蛋白質組學服務解決方案，以推進生物學研究和藥物發(fā)現。我們通過基于AI的計算方案，為您提供對蛋白質組學、基因組學和醫(yī)學的卓越洞見。旗下著名的PEAKS®️系列軟件在全世界擁有數千家學術和工業(yè)用戶，包括：PEAKS®️ Studio，PEAKS®️ Online，PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB，ProteoformXTM ，DeepImmu®️免疫肽組發(fā)現服務和抗體綜合表征服務等。
Email: sales-china@bioinfor.com 電話：021-60919891
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