如何快速查找LncRNA序列

瀏覽次數(shù)：6783　發(fā)布日期：2018-11-28　來(lái)源：本站　僅供參考，謝絕轉(zhuǎn)載，否則責(zé)任自負(fù)

查找LncRNA序列的網(wǎng)站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數(shù)據(jù)庫(kù)等。今天，小編就給大家講講如何通過(guò)LncRNA ID號(hào)查找LncRNA的序列。
一．根據(jù)LncRNA來(lái)源數(shù)據(jù)庫(kù)，進(jìn)入相應(yīng)鏈接。
1. Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
二．根據(jù)“gene_id”查看LncRNA在所屬數(shù)據(jù)庫(kù)的ID號(hào)。
1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
紅框內(nèi)輸入gene_id號(hào)，點(diǎn)擊search。假設(shè)gene_id為AK009210。

點(diǎn)擊FASTA鍵，復(fù)制獲取序列。

2. Ensmbl：http://asia.ensembl.org/index.html
選擇物種類別，詳見(jiàn)Report-Sequence_Results-Supplementary（可選項(xiàng)）。紅框內(nèi)輸入gene_id號(hào)，點(diǎn)擊GO。假設(shè)gene_id為ENSMUSG00000099021。