生物樣本庫核酸樣本質(zhì)控方法

生物樣本庫（Biobank），又被成為生物銀行。根據(jù)經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)的定義，"生物樣本庫(Biobank)是一種集中保存各種人類生物材料(Human biological material)，用于疾病的臨床治療和生命科學(xué)研究的生物應(yīng)用系統(tǒng)"。根據(jù)GB/T 37864-2019《生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求》等指導(dǎo)文件，生物樣本庫必須做好核酸質(zhì)控，包括對DNA，RNA樣本的純度，濃度以及完整性做好檢測。

 

 

核酸樣本質(zhì)控方法推薦

根據(jù)GB/T40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評價(jià)方法》，分別對DNA和RNA樣本的濃度、純度、完整性提出了推薦的質(zhì)控方法。

• 濃度：分光廣度法、熒光染料檢測法 熒光定量 PCR法和數(shù)字 PCR法
• 純度：分光光度法和 瓊脂糖凝膠電泳法
• 完整性：凝膠電泳法， 毛細(xì)管凝膠電泳法（安捷倫Tapestaion分析儀） 和微流控分析法（安捷倫2100生物分析儀）

 

核酸樣本質(zhì)控

1、安捷倫2100生物分析儀

2100生物分析儀是核酸質(zhì)控屆的常青樹，是國際生物和環(huán)境樣本庫協(xié)會(huì)（ISBER）《生物樣本庫最佳實(shí)踐》，GB/T 40664-2021《用于高通量測序的核酸類樣本質(zhì)量控制通用要求》，GB/T 40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評價(jià)方案》等指導(dǎo)文件中推薦的生物樣本庫核酸質(zhì)控方法。

2100生物分析儀采用微流控芯片技術(shù)，樣本進(jìn)入芯片后，進(jìn)行電泳分離。使用數(shù)字化評價(jià)體系，評估樣本質(zhì)量，其中RNA完整性指標(biāo)RIN值是業(yè)內(nèi)公認(rèn)的金標(biāo)準(zhǔn)。

 

圖 1 微流控芯片示意圖

 

2、安捷倫Tapestation 分析儀

Tapestation 是安捷倫旗下推出一款獨(dú)創(chuàng)的膠條式自動(dòng)化電泳分析儀，也是國內(nèi)外眾多生物樣本庫核酸質(zhì)控的選擇。這款儀器自動(dòng)化程度非常高，用預(yù)制膠條取代傳統(tǒng)繁瑣的制膠過程，膠條采用獨(dú)立泳道，有效避免污染。

 

圖 2 Tapestation 預(yù)制膠條

 

Tapestation 共有兩款型號(hào)，提供靈活通量，減少單次上機(jī)成本。

 

• 4150 TapeStation

– 從兩個(gè) 8 聯(lián)管上樣

– 完整的可擴(kuò)展性：可分析 1–16 范圍內(nèi)任意數(shù)量的樣品

– 16 個(gè)樣品在 20 分鐘內(nèi)即可獲得可靠且可重現(xiàn)的結(jié)果

– 占地面積小，節(jié)省寶貴的實(shí)驗(yàn)室臺(tái)面空間

 

• 4200 TapeStation

– 可對多達(dá) 96 個(gè)樣品進(jìn)行全自動(dòng)樣品處理

– 從兩個(gè) 8 聯(lián)管或一個(gè) 96 孔板上樣

– 完整的可擴(kuò)展性：可分析 1–96 范圍內(nèi)任意數(shù)量的樣品

– 1–2 分鐘內(nèi)即可獲得一個(gè)樣品的可靠重現(xiàn)結(jié)果，90 分鐘內(nèi)可獲得 96 個(gè)樣品的結(jié)果

 

圖 3 Tapestation 分析儀 ，型號(hào)4150（左），型號(hào)4200（右）

 

Reference：

1、GB/T 37864-2019《生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求》

2、GB/T 40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評價(jià)方案》

3、安捷倫5991-3143ZHCN