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DSP空間組學(xué)助力揭秘食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)生態(tài)演變空間分子圖譜

瀏覽次數(shù):69 發(fā)布日期:2026-3-16  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

近期,河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院科研團(tuán)隊(duì)于國(guó)際權(quán)威期刊《Cell Reports Medicine》發(fā)表了一項(xiàng)突破性研究成果。該團(tuán)隊(duì)借助Nanostring GeoMx空間組學(xué)(Digital Spatial Profiling,簡(jiǎn)稱DSP)技術(shù)(點(diǎn)擊),對(duì)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)組織樣本展開(kāi)空間轉(zhuǎn)錄組分析,成功繪制出涵蓋從正常上皮、癌前病變,到浸潤(rùn)性癌以及轉(zhuǎn)移灶的ESCC全周期空間分子圖譜。

這一成果不僅揭示了腫瘤微環(huán)境(TME)在疾病發(fā)展進(jìn)程中的動(dòng)態(tài)重塑特性,還精準(zhǔn)定位了一個(gè)在晚期特異性激活的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)基因——OGT,為食管癌的早期預(yù)警和晚期精準(zhǔn)治療提供了全新的理論支撐與潛在靶點(diǎn)。

一、技術(shù)策略:基于DSP ROI圈選策略的全轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
鑒于ESCC組織具有顯著的異質(zhì)性,研究團(tuán)隊(duì)選用了Nanostring GeoMx DSP平臺(tái)開(kāi)展研究。該技術(shù)的一大優(yōu)勢(shì)在于,能在保留組織形態(tài)學(xué)背景的基礎(chǔ)上,利用熒光標(biāo)記抗體,精準(zhǔn)選取特定的感興趣區(qū)域(Region of Interest,簡(jiǎn)稱ROI)進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。

此次研究共納入18例患者的32個(gè)樣本,這些樣本涵蓋了正常組織、癌前病變(ESPL)、原發(fā)灶(非轉(zhuǎn)移/轉(zhuǎn)移)以及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶等ESCC發(fā)展的關(guān)鍵階段。在病理醫(yī)師的專業(yè)指導(dǎo)下,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)腫瘤上皮區(qū)、免疫富集區(qū)及基質(zhì)區(qū)進(jìn)行了精準(zhǔn)圈選,從而獲得了帶有明確空間注釋的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。這一方法在保留組織結(jié)構(gòu)信息的同時(shí),實(shí)現(xiàn)了對(duì)不同病變階段分子特征的定量比較。

二、主要研究發(fā)現(xiàn)
1、癌前病變階段:分化異常與早期免疫應(yīng)答

研究發(fā)現(xiàn),ESCC起始階段的核心分子事件是表皮發(fā)育通路與角質(zhì)形成細(xì)胞分化通路的協(xié)同失調(diào)。在癌前病變組織中,胚胎樣基因出現(xiàn)異常激活,進(jìn)而引發(fā)角質(zhì)形成細(xì)胞去分化。與此同時(shí),免疫細(xì)胞浸潤(rùn)出現(xiàn)失衡現(xiàn)象,具體表現(xiàn)為B細(xì)胞浸潤(rùn)數(shù)量增多,而T細(xì)胞浸潤(rùn)數(shù)量減少,形成了一種有利于腫瘤發(fā)生的“免疫失衡微環(huán)境”,為癌變的啟動(dòng)創(chuàng)造了前提條件。

2、浸潤(rùn)進(jìn)展期:免疫抑制微環(huán)境悄然成型
當(dāng)病變逐步發(fā)展至浸潤(rùn)性癌階段,腫瘤微環(huán)境發(fā)生了顯著變化。研究結(jié)果表明,CD8+ T細(xì)胞和CD4+ T細(xì)胞在腫瘤區(qū)域的浸潤(rùn)數(shù)量相對(duì)減少,而具備免疫抑制特性的巨噬細(xì)胞以及特定中性粒細(xì)胞亞群的比例卻有所上升。通過(guò)空間共定位分析進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),原本發(fā)揮重要免疫功能的三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)(TLS)逐漸出現(xiàn)功能失調(diào),其招募效應(yīng)T細(xì)胞的能力明顯減弱,腫瘤細(xì)胞周圍慢慢構(gòu)筑起一道免疫抑制屏障,使得腫瘤細(xì)胞能夠在相對(duì)“安全”的環(huán)境中繼續(xù)生長(zhǎng)和擴(kuò)散。

3、晚期轉(zhuǎn)移階段:PI3K/AKT通路激活與OGT的關(guān)鍵角色
在晚期以及發(fā)生轉(zhuǎn)移的病灶中,與細(xì)胞促生存和增殖密切相關(guān)的PI3K/AKT信號(hào)通路持續(xù)處于高度激活狀態(tài)。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選,并結(jié)合臨床預(yù)后情況展開(kāi)關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)OGT基因在晚期腫瘤細(xì)胞中呈現(xiàn)出特異性高表達(dá)的特征,而且其表達(dá)水平與患者的不良預(yù)后情況呈現(xiàn)出正相關(guān)關(guān)系,這意味著OGT基因在晚期食管癌的發(fā)展過(guò)程中可能扮演著重要角色。

三、機(jī)制驗(yàn)證與功能研究:揭開(kāi)OGT的神秘面紗
為了深入探究OGT在食管癌進(jìn)展過(guò)程中的具體功能,研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)展了一系列體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)。

(1)表型影響在食管癌細(xì)胞系中,當(dāng)降低OGT的表達(dá)水平時(shí),細(xì)胞的遷移和侵襲能力會(huì)受到顯著抑制,在小鼠模型中,肺轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)的數(shù)量也明顯減少;相反,如果過(guò)表達(dá)OGT,則會(huì)呈現(xiàn)出促進(jìn)癌癥發(fā)展的效應(yīng),細(xì)胞的遷移和侵襲能力增強(qiáng),小鼠模型中的肺轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)數(shù)量增多。

(2)分子機(jī)制實(shí)驗(yàn)證實(shí),OGT能夠通過(guò)催化蛋白質(zhì)進(jìn)行O - GlcNAc糖基化修飾,增強(qiáng)AKT蛋白的磷酸化水平,進(jìn)而激活下游信號(hào)通路,推動(dòng)細(xì)胞周期進(jìn)程并抑制細(xì)胞凋亡,為腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)和擴(kuò)散提供有利條件。

(3)空間關(guān)聯(lián)結(jié)合DSP數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),OGT高表達(dá)的區(qū)域往往伴隨著免疫活性信號(hào)的降低,這提示OGT可能通過(guò)代謝重編程的方式參與到免疫抑制微環(huán)境的維持過(guò)程中,為腫瘤細(xì)胞逃避機(jī)體免疫監(jiān)視創(chuàng)造條件。  

四、科學(xué)意義與應(yīng)用前景:開(kāi)辟食管癌研究新路徑
該研究借助DSP空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),客觀且全面地展示了食管癌從癌前病變到發(fā)生轉(zhuǎn)移過(guò)程中微環(huán)境的空間演化軌跡。

研究不僅清晰地明確了不同發(fā)展階段的分子特征,還通過(guò)功能實(shí)驗(yàn)有力地驗(yàn)證了OGT作為晚期食管癌關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因子的潛在價(jià)值。研究團(tuán)隊(duì)指出,OGT有望成為評(píng)估食管癌進(jìn)展風(fēng)險(xiǎn)的新型生物標(biāo)志物,為臨床診斷和預(yù)后判斷提供重要依據(jù)。針對(duì)OGT及其下游通路制定干預(yù)策略,或許能夠?yàn)橥砥谑彻馨┗颊邘?lái)新的治療希望和思路。

此外,該研究也充分展示了DSP技術(shù)在解析復(fù)雜腫瘤生態(tài)系統(tǒng)方面的獨(dú)特優(yōu)勢(shì),它無(wú)需依賴單細(xì)胞解離,就能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)特定組織區(qū)域的高通量分子表征,為腫瘤研究提供了新的技術(shù)手段和方法。

五、揭秘ESCC生態(tài)演變的空間組學(xué)DSP技術(shù)哪個(gè)公司有?
樂(lè)備實(shí)LabEx提供一站式DSP空間組學(xué)服務(wù):

貨號(hào) 產(chǎn)品名
LXDSWH12-1 DSP人空間全轉(zhuǎn)錄組圖譜_WTA_12檢測(cè)服務(wù)
LXDSCH72-1 DSP人癌癥空間轉(zhuǎn)錄組圖譜_CTA_72檢測(cè)服務(wù)
LXDSPH96-IPA DSP人空間蛋白組圖譜_570蛋白_96檢測(cè)服務(wù)
LXDSPH192-DPA DSP人空間蛋白組圖譜_1200蛋白_192檢測(cè)服務(wù)
LXDSWM12-1 DSP小鼠空間全轉(zhuǎn)錄組圖譜_WTA_12檢測(cè)服務(wù)

樂(lè)備實(shí)(上海優(yōu)寧維生物科技股份有限公司旗下全資子公司),是國(guó)內(nèi)專注于提供高質(zhì)量蛋白檢測(cè)以及組學(xué)分析服務(wù)的實(shí)驗(yàn)服務(wù)專家,自2018年成立以來(lái),樂(lè)備實(shí)不斷尋求突破,公司的服務(wù)技術(shù)平臺(tái)已擴(kuò)展到單細(xì)胞測(cè)序、空間多組學(xué)、流式檢測(cè)、超敏電化學(xué)發(fā)光、Luminex多因子檢測(cè)、抗體芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫組化、DSP空間多組學(xué)等30多個(gè),建立起了一套涵蓋基因、蛋白、細(xì)胞以及組織水平實(shí)驗(yàn)的完整檢測(cè)體系。

原文點(diǎn)擊:《Cell Reports Medicine》刊載:以DSP空間組學(xué)揭秘ESCC生態(tài)演變
發(fā)布者:上海優(yōu)寧維生物科技股份有限公司
聯(lián)系電話:15921930842
E-mail:yh-wang@univ-bio.com

標(biāo)簽: DSP 空間組學(xué) ESCC
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