SPT 移液工作站+Thermo Collibri試劑盒打造低成本自動化NGS建庫方案

SPT Labtech宣布與Thermo Fisher Scientific合作，推出低成本自動化NGS建庫解決方案

文庫制備成本在如今大規(guī)模的NGS研究費用中所占的比重越來越重，經費和成本的限制阻礙了科學家對傳染病監(jiān)測、癌癥研究等領域更深入探索的步伐。SPT Labtech宣布與Thermo Fisher Scientific進行市場合作，旨在構建自動化的文庫制備方案，以期提高建庫成功率，并降低variant檢測的費用。
 

高靈敏度的variant檢測現在可以通過使用SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統進行自動化建庫，將反應體系微縮化，減少試劑使用量，降低1/10的成本，從而能夠在一組樣本中添加更多的replicates，提高建庫成功率和測序數據質量。
 
此項方案將首先支持用于Illumina系統的Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒，以及Collibri文庫定量試劑盒，包括SARS-CoV-2研究、癌癥研究中拷貝數變異以及其他突變檢測的應用。
 
更高的效率
SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統可以快速編程，24/7全天候進行樣本制備工作，解放研究人員的時間。
 

圖：dragonfly discovery、mosquito HV genomics 及NGS實驗set up專用軟件

 
更高的成功率
使用SPT Labtech設備進行微縮化建庫，可將試劑的用量體積減少多達10倍，從而可以用不到1個樣本的成本，做5–6個replicates。樣本重復數量的增加，保障了即使某個樣品在flow cell上測序失敗，仍有其他樣品的數據可以使用，無需再重新準備樣本展開測序，從而確保了實驗一次成功。Invitrogen Collibri NGS文庫制備試劑盒中每種試劑含有一種示蹤染料，通過顏色變化可清晰觀察文庫制備過程，避免高代價的實驗失誤。
 

圖：dragonfly discovery每個通道可以獨立進行試劑分配

 
更微量的樣本
SPT Labtech設備獨有的固相置換技術可以精確地處理微量液體，對0.5uL的粘稠樣本都有著極高的加樣精度。Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒可從1 ng的樣本起始量提供均勻的基因組覆蓋度。Collibri ES DNA PCR-free建庫方案經過優(yōu)化，可將 100 ng DNA 制備成足量測序文庫，足以用于文庫定量及在 Illumina NovaSeq 系統上進行兩次以上測序。PCR-free的建庫流程可在1.5小時內完成，一天內就可以將DNA轉化為數據，從而最大限度地提高實驗效率。
 

圖：mosquito HV genomics的8/16通道進行樣本和index轉移

 
加速科學發(fā)現：提高實驗成功率并降低研究成本
SPT Labtech 的產品戰(zhàn)略總監(jiān)Joby Jenkins表示，在不犧牲結果質量的前提下降低NGS建庫成本是朝著科學民主化邁出的一大步。NGS技術發(fā)展迅速，對于每個實驗室來說，將最新的建庫方法進行自動化的流程搭建將會非常耗時，而我們的目標就是實現NGS建庫過程的自動化和微縮化，解決技術和方法上的挑戰(zhàn)，這樣科學家們就可以更關注于科學問題本身，擴大他們研究項目的范圍，最終對生命科學和人類健康產生更深刻的見解。
 
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