INTEGRA自動化移液方案助力全球最大scRNA-seq數(shù)據(jù)集

單細胞RNA測序（scRNA-seq）正在迅速成為藥物研發(fā)中的標準方法，在多個治療領(lǐng)域內(nèi)逐漸取代傳統(tǒng)的混合RNA測序技術(shù)�？偛课挥诩永�福尼亞州舊金山的Tahoe Therapeutics正在使用scRNA-seq技術(shù)來生成全球最大的單細胞數(shù)據(jù)集。該公司將ASSIST PLUS移液工作站與Parse Biosciences的Evercode™技術(shù)相結(jié)合，以流暢推進其研究突破，提高可靠性，并將手工操作時長縮短高達75%。

藥物研發(fā)中的單細胞RNA測序
Tahoe Therapeutics（原Vevo Therapeutics）成立于2022年，其目標是利用單細胞RNA測序技術(shù)（scRNA-seq）構(gòu)建全球最大的圖譜來描繪藥物如何與患者細胞相互作用。該公司已針對多種癌癥類型并行開展了數(shù)個項目，并且目前正在將研究擴展到更廣泛的治療領(lǐng)域，包括心血管、代謝以及神經(jīng)退行性疾病等。

Tahoe Therapeutics之所以選擇這種方法，是因為 scRNA-seq能夠產(chǎn)出的數(shù)據(jù)量遠超傳統(tǒng)測序工作流程。公司聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席科學官Johnny Yu解釋說：“scRNA-seq使我們得以深入了解不同細胞類型對藥物的不同反應(yīng)，而常規(guī)的混合測序則很難揭示這些差異。我們使用高通量方法在單細胞水平上產(chǎn)生了大量數(shù)據(jù)。公司的首個數(shù)據(jù)集Tahoe 100 million是該領(lǐng)域有史以來規(guī)模最大的。實際上，它將過去十年累計生成的公開數(shù)據(jù)總量翻了一番。”

自動化優(yōu)化工作流程
Tahoe Therapeutics利用復(fù)雜的生物模型系統(tǒng)開發(fā)了自己的生物檢測方法。近日，公司使用Parse Biosciences的Evercode試劑盒來進行單細胞RNA測序（scRNA-seq），以確保數(shù)據(jù)生成的可擴展性，從而為其藥物研發(fā)模型提供信息。該公司的目標是構(gòu)建全球最大的scRNA-seq數(shù)據(jù)集，因此，實驗室自動化對其團隊而言至關(guān)重要。“我們很快便意識到，隨著生成的數(shù)據(jù)越來越多，不斷拓展該領(lǐng)域的邊界，我們也迫切地需要機器人和高通量的解決方案，”Johnny補充說。

基于INTEGRA與Parse Biosciences的合作，前者的解決方案自然成為了Tahoe Therapeutics滿足其自動化需求的首選，這些經(jīng)過驗證的全流程方案覆蓋了scRNA-seq樣品制備每個階段。Johnny及其團隊使用ASSIST PLUS移液工作站配合8通道的VIAFLO手持式電動移液器實現(xiàn)了Evercode sc-RNA-seq工作流程的自動化。“ASSIST PLUS移液工作站的主要優(yōu)勢之一是其靈活性。該系統(tǒng)專門為Parse Evercode單細胞工作流程內(nèi)置了預(yù)設(shè)方案，同時我們也能快速編制不同的程序，以完成scRNA-seq樣品制備之外的各種任務(wù)。”Johnny解釋道：“這一點非常重要，因為像我們這樣的小型實驗室需要運行很多不同的流程。”對于一個技能組合多樣的小團隊而言，易于編程，能夠從容應(yīng)對多種任務(wù)是至關(guān)重要的。“ASSIST PLUS與其他昂貴的自動化解決方案的重要區(qū)別之一在于，你不必是一位擁有多年系統(tǒng)經(jīng)驗的自動化工程師，”Johnny說道。“我們的兩位方法開發(fā)人員沒有任何自動化背景，但他們卻能快速地將新方法推廣給團隊的其他成員。”

該團隊的工作流程需要基于精確的時間節(jié)點緊密協(xié)調(diào)，同時，活細胞的操作則必須快速而輕柔。INTEGRA自動化解決方案的速度配合Parse Biosciences的產(chǎn)品，能夠并行處理大批量的生物樣本。隨著Tahoe Therapeutics研究規(guī)模的擴大，其構(gòu)建的數(shù)據(jù)集規(guī)模將超過Tahoe 100 million這一創(chuàng)紀錄集合的50倍，因此，這套系統(tǒng)的速度、準確性和可重復(fù)性將是至關(guān)重要的。“自動化大大提高了我們的數(shù)據(jù)生成通量，使工作流程中的單細胞制備效率提升了5倍以上，”Johnny解釋道。“最重要的是，它非常精確——你不必再受制于手動操作難以避免的差異性了。”
  出色的客戶服務(wù)與技術(shù)支持
INTEGRA的自動化實驗室解決方案已成為公司運營的必備要素，因此，高水平的客戶服務(wù)與技術(shù)支持也變得非常重要。Tahoe Therapeutics團隊享受了全天候的快速響應(yīng)服務(wù)，并且獲得了定制化的購買建議來幫助其簡化工作流程。“INTEGRA的服務(wù)和銷售是緊密結(jié)合的，我認為這樣非常有幫助，”Johnny解釋道。“我與我們的銷售代表相熟，有一次甚至在她飛行途中聯(lián)系過，我相信她會站在我們團隊一邊，找到解決當前問題的正確方案。我認為這種關(guān)系是INTEGRA與眾不同的原因之一。”

渾然一體的液體處理和二代測序平臺
INTEGRA自動化移液工作站與Parse Biosciences單細胞測序方案的結(jié)合，為Tahoe Therapeutics提供了一套協(xié)調(diào)統(tǒng)一的解決方案。ASSIST PLUS強大而直觀的編程與操作方式，加上INTEGRA出色的技術(shù)支持，使該公司得以不斷突破行業(yè)邊界，并且領(lǐng)先于使用老舊技術(shù)的競爭對手。“許多最新的生物制藥研究仍然基于混合RNA測序這種十年之前的方法，”Johnny說。“我們所使用的技術(shù)使我們能夠超越眾多的生物制藥公司，以更少的儀器、試劑和資金構(gòu)建出更大的數(shù)據(jù)集。”

ASSIST PLUS廣泛適用于各種生命科學應(yīng)用，包括scRNA-seq。瀏覽我們的應(yīng)用頁面，了解這款功能強大的移液工作站如何簡化您的實驗室流程。